秦王府的文武官员都担心和害怕起来，处在这种情况下不知道该如何应对才好。行台考功郎中房玄龄告诉比部郎中长孙无忌说:“现在矛盾已经形成，一旦灾难的导火线暗中引发，哪里只是整个秦王府彻底毁灭，实在会给整个国家带来很大的忧患。不如劝秦王实行周公旦诛杀管叔、蔡叔的办法来安定国家。当前正是生死存亡关头，千钧一发之际呵！”长孙无忌说:“我考虑到这种情况已经很久了，只是不敢说出口来；今天您所讲的，正符合我的心意，我们应该很谨慎地向秦王说清楚这个问题。”于是就进去对李世民说了。李世民为此召见房玄龄商议这件事。玄龄说:“大王功业盖过天地，照理应该是皇位的继承人，如今处在忧患危险之中，这是天帮助大王成就大事，希望大王不要疑惑。”说完之后，就和秦王府的属官杜如晦一起劝说李世民除掉太子李建成和齐王李元吉。
李建成、李元吉认为秦王府有很多勇将，想引诱他们来为自己出力，就暗地里把一车金银制品送给左二副护军尉迟敬德，同时用一封信去招他，写道:“很想得到您老人家的垂青，以便加深我们之间像老百姓一样的交情。”尉迟敬德推辞说:“敬德是一个用蓬草编门、破瓮当窗的穷人，遇到隋朝末年的战乱，人民流离失所，我长期沦落在叛逆的地方，罪孽很大，完全该杀。秦王赐给我重生的大恩，现在又让我在他王府里留名、任职，我想我只有粉身碎骨来报答他；而对于殿下，我一点功劳也没有，不敢错领您这份优厚的赏赐。假如我私下结交殿下，那就是有了两种心意，曲从私利，忘掉忠诚，这样的人对殿下还有什么用处呢？”李建成得讯后非常生气，就和尉迟敬德断交了。
敬德就把这件事告诉了李世民，李世民说:“您的思想品德像泰山一样崇高，即使赠送的金银财宝堆积得碰到北斗星，知道您还是不会变心的。有人送您东西，您只管接受，不会有什么嫌疑的！况且借此机会还能知道他们的阴谋，难道不是很好的计策吗？不这样，灾祸将会降到您的身上。”果然不出所料，不久以后，李元吉派遣壮士于夜里来暗杀尉迟敬德。敬德发觉了，把家里的几道门都开得很大，静静地躺在床上不动。刺客多次走到他的庭院，始终不敢进入寝室。一计不成，又生一计，李元吉就在皇帝面前说敬德的坏话。皇帝命令把尉迟敬德逮捕起来，下狱审讯，结果，准备把他处死。李世民知道后，就坚决请求免予处分，终于使他获释。李元吉又在皇帝面前说左一马军总管程知节的坏话，要把程知节赶出秦王府，调到康州去当刺史。程知节对李世民说:“大王身边的得力助手被驱赶光了，自身的安全怎能久保！知节到死也不离开您，只希望早点决定大计。”李建成、李元吉又用金帛引诱右二护军段志玄，段志玄也不肯接受。建成对元吉说:“秦王府智慧谋略的人中间，最可怕的只是房玄龄、杜如晦罢了。”二人又在皇帝面前说他们的坏话，把他们赶出了秦王府。
李世民的亲信只有长孙无忌还在秦王府中。他与雍州治中高士廉(高是李世民妻子长孙皇后的舅舅)、右候车骑将军三水人侯君集和尉迟敬德等，日日夜夜劝李世民杀掉李建成和李元吉。李世民拿不定主意，去问灵州大都督李靖，李靖不肯说什么；又去问行军总管李世勣，李也不肯说什么。李世民因此更加敬重这两个人。
